一、个人简历
工作经历
2023.02-至今 道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室 青年 PI
2021.12-至今 中国中医科学院中药资源中心 副研究员
2015.8-2021.12 中国中医科学院中药资源中心 助理研究员
学习经历
2005年 9月-2009 年 6 月 东北林业大学 学士学位 生命科学
2009年 9月-2015 年 7 月 中国科学院遗传与发育生物学研究所 理学博士 生物信息
二、教学科研情况（包括主要在研课题、获奖成果等）
教学情况：承担研究生课程《生物信息学和高通量测序分析》（2025-2026，屠呦呦班课程，36 学时）、 《2024 年中医药生物信息实战第一期》 （2024 讲座课，12 学时）、《分子生物学导论》（2023,2024,4 学时）、《分子生药学》（2018-2022,2 学时）。
在研课题：主持中国中医科学院优秀青年科技人才（创新类）培养专项等课题。获奖成果：研究获评中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展、中国中医科学院科学技术奖一等奖
学术活动：运营有十六万人关注的微信公众号《生信宝典》，分享有2500 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频，阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊(影响因子：33.2)，现为执行主编，致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
三、论著情况（包括代表性论文、专著、教材）
1. Chen,T*, Liu,Y.-X.*, Chen,T., Yang,M., Fan,S., Shi,M., Wei,B., Lv,H., Cao,W., Wang,C., Cui,J., Zhao,J., Han,Y., Xi,J., Zheng,Z., and Huang,L.*. (2024). ImageGP 2 for enhanced data visualization and reproducible analysis in biomedical research. iMeta 3,5, e239
2. Chen,T.†, Yang, M.†, Cui, G., Tang, J., Shen, Y., Liu, J., Yuan, Y.*, Guo, J.* and Huang, L.*. (2024) IMP: Bridging the Gap for Medicinal Plant Genomics. Nucleic Acids Res, 52(D1):D1347-D1354
3. Huang,L.†, Wang,D.†, Chen,H., Hu,J., Dai,X., Liu,C., Li,A., Shen,X., Qi,C., Sun,H., Zhang,D., Chen,T.*, Jiang,Y.*.(2023) CRISPR-detector: fast and accurate detection, visualization, and annotation of genome-wide mutations induced by genome editing events. Journal of Genetics and Genomics 50:563-572. 并列通讯
4. Lei,B., Xu,Y., Lei,Y., Li,C., Zhou,P., Wang,L., Yang,Q., Li,X., Li,F., Liu,C., Cui C, Chen T*, Ni W*, Hu SW*. (2023) CRAMdb: a comprehensive database for composition and roles of microbiome in animals. Nucleic Acids Res, 51, D700–D707. 并列通讯
5. Chen,T., Liu,Y.-X. and Huang,L. ImageGP: An easy-to-use data visualization web server for scientific researchers. iMeta, 2022, 1(1):e5.
6. Chen T., Zhang H., Liu Y., Liu Y.-X.*, and Huang, L.*. (2021). EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online. Journal of Genetics and Genomics 48(9):863-866
7. Liu Y.-X.†*, Qin Y. †, Chen, T. †, Lu, M., Qian, X., Guo, X., and Bai, Y.*. (2021). A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data. Protein Cell 12, 315–330. 并列一作
8. Ma, Y. †, Cui, G. †*, Chen, T. †, Ma, X., Wang, R., Jin, B., Yang, J., Kang, L., Tang, J., Lai, C., et al. (2021). Expansion within the CYP71D subfamily drives the heterocyclization of tanshinones synthesis in Salvia miltiorrhiza. Nat Commun 12, 685. 并列一作
9. Gao J.†, Chen T.*, Jiang, C. et al. (2021). Comparative anatomical and transcriptomic analyses of the color variation of leaves in Aquilaria sinensis. PeerJ 9, e11586. 并列通讯
10. Liu, J.†, Chen, T.†, Zhang, J .†, Li, C., Xu, Y., Zheng, H., Zhou, J., Zha, L., Jiang, C., Jin, Y., et al. (2020). Ginsenosides regulate adventitious root formation in Panax ginseng via a CLE45-WOX11 regulatory module. J Exp Bot 71, 6396–6407. 并列一作
11. Tong Chen, Ya-Juan Hao, Ying Zhang, Miao-Miao Li, Meng Wang, Weifang Han, Wu,Y., Lv,Y., Hao,J., Wang,L., et al. (2015) m6A RNA Methylation Is Regulated by MicroRNAs and Promotes Reprogramming to Pluripotency. Cell Stem Cell, 16, 289–301. 封面文章
四、主要研究方向，研究生带教情况
2009 年本科毕业于东北林业大学，2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所，数据驱动的中药道地性形成和高品质生产研究开展：⑴ 中药大数据资源底座的持续建设；⑵ 中药大数据资源的智算整合挖掘。以及基于数据库联合开展①中药道地性形成分子机制研究；②高品质中药生产和鉴定；③中药合成生物学研究和中药新资源挖掘等，在 iMeta, Cell Stem Cell (封面文章)，Nucleic Acids Research，Nature communications, Protein & Cell等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十二篇，累积引用 4800 +次；开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP （获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一），使用超 300 万人次，3 篇文章获评科睿唯安 ESI 高被引论文（Top 1%）；运营有十六万人关注的微信公众号《生信宝典》，分享有2500 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频，阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊(影响因子：33.2)，现为执行主编，致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
五、联系方式：办公电话（系统安全问题，不要留手机号）、邮箱
电话：010-64087469
邮箱：chentong_biology@163.com
